Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGB2Q6NT52 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms