Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC70Q6NSX1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms