Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SDE2Q6IQ49 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDE2Q6IQ49 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms