Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SUMO4Q6EEV6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms