Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA2Q69YH5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA2Q69YH5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA2Q69YH5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms