Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUPD1Q68J44 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUPD1Q68J44 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms