Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ALS2CLQ60I27 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ALS2CLQ60I27 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms