Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ECM29Q5VYK3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ECM29Q5VYK3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ECM29Q5VYK3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM29Q5VYK3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms