Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD4Q5VX71 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUSD4Q5VX71 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms