Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPATA1Q5VX52 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA1Q5VX52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPATA1Q5VX52 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms