Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YOD1Q5VVQ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
YOD1Q5VVQ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YOD1Q5VVQ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms