Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DIPQ5VU43 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDE4DIPQ5VU43 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE4DIPQ5VU43 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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