Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RPRD2Q5VT52 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RPRD2Q5VT52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RPRD2Q5VT52 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms