Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKAP1Q5VSY0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GKAP1Q5VSY0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms