Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms