Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC9C2Q5TAH2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC9C2Q5TAH2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC9C2Q5TAH2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms