Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC18Q5T9S5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CCDC18Q5T9S5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CCDC18Q5T9S5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms