Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP58Q5T655 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP58Q5T655 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP58Q5T655 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP58Q5T655 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP58Q5T655 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP58Q5T655 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP58Q5T655 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CFAP58Q5T655 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CFAP58Q5T655 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP58Q5T655 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP58Q5T655 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP58Q5T655 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP58Q5T655 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP58Q5T655 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFAP58Q5T655 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms