Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BEND3Q5T5X7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BEND3Q5T5X7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
BEND3Q5T5X7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BEND3Q5T5X7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BEND3Q5T5X7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BEND3Q5T5X7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms