Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF3Q5SZQ8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF3Q5SZQ8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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