Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FRMPD1Q5SYB0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FRMPD1Q5SYB0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms