Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C10orf55Q5SWW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C10orf55Q5SWW7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms