Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C6orf10Q5SRN2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C6orf10Q5SRN2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms