Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTC38Q5R3I4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTC38Q5R3I4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms