Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAMD4BQ5PRF9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SAMD4BQ5PRF9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms