Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CEP78Q5JTW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms