Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XKR3Q5GH77 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XKR3Q5GH77 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XKR3Q5GH77 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms