Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF628Q5EBL2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF628Q5EBL2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms