Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAVIN4Q5BKX8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN4Q5BKX8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms