Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFT2D3Q587I9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SFT2D3Q587I9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms