Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC23Q53EV4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC23Q53EV4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms