Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIN52Q52LA3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIN52Q52LA3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN52Q52LA3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms