Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYTL3Q4VX76 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYTL3Q4VX76 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYTL3Q4VX76 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms