Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIT3Q3SXY7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT3Q3SXY7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms