Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRFIP1Q32MZ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms