Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KLHL40Q2TBA0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL40Q2TBA0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL40Q2TBA0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms