Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms