Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VMACQ2NL98 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VMACQ2NL98 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VMACQ2NL98 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms