Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRED3Q2MJR0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms