Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKIDA1Q1XH10 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIDA1Q1XH10 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms