Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNOP1Q1ED39 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNOP1Q1ED39 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms