Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LONRF1Q17RB8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LONRF1Q17RB8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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