Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDR2Q16832 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDR2Q16832 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDR2Q16832 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms