Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPP1Q16831 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms