Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
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FOXD1Q16676 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
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FOXD1Q16676 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
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FOXD1Q16676 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
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FOXD1Q16676 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXD1Q16676 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
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FOXD1Q16676 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
FOXD1Q16676 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
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