Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMN1Q16637 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMN1Q16637 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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