Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABRA6Q16445 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GABRA6Q16445 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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