Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK4Q16099 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK4Q16099 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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