Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP3Q15836 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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