Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCP1Q15431 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP1Q15431 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
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