Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RYR3Q15413 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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